Latvijas īpaši aizsargājamo sugu sarakstā patlaban ir ierakstītas 103 putnu sugas, no kurām 99 sugas ir īpaši aizsargājamas, bet 4 sugas ir ierobežoti izmantojamas īpaši aizsargājamas sugas. Dabas parkā “Salacas ieleja” patlaban zināmas 44 īpaši aizsargājamas putnu sugas. To par gana labu mājvietu atzinuši baltais stārķis, dzērve, grieze, brūnā čakste, lielā gaura, jūras ērglis, mazais ērglis, mazais mušķērājs, baltmugurdzenis, zivjdzenītis, Latvijas mazākā pūcīte – apodziņš, kā arī daudzas citas putnu sugas. Kā lielākie retumi minami tādas putnu sugas kā urālpūce, bikšainais apogs, melnais stārķis un mednis.